Ek het die bewyse van die vroeë verspreiding van die virus in 2019 en die eerste bevestigde gevalle en ek het uitgekom by wat ek dink die mees waarskynlike verloop van gebeure is vir hoe die virus ontstaan het.
Om 'n lang(e) storie kort te maak, dit lyk asof die virus teen die tweede helfte van November 2019 wêreldwyd versprei het. Die deel wat moeilik was om te verstaan, was hoekom, as dit daardie winter in lande regoor die wêreld was, die plofbare uitbrake eers in Februarie en Maart 2020 begin het.
As ons weer in detail na die verslae oor die opkoms van die virus kyk, blyk dit dat dit is omdat die virus se reis van die eerste opkoms in die herfs van 2019 tot plofbare uitbrake vroeg in 2020 op 'n stadiger en meer geleidelike manier plaasgevind het as wat ons sou verwag van 'n eenvoudige begrip van virusse. Dit is nie omdat die virus nie in lande teenwoordig was voordat dit plofbare uitbrake daar veroorsaak het nie – dit is die simplistiese aanname wat deur die data weerspreek word – maar omdat die virus nie altyd plofbare uitbrake veroorsaak wanneer dit teenwoordig is nie.
Dit wil voorkom asof die nuwe SARS-agtige virus mense teen die einde van Oktober 2019 begin besmet het. Dit was baie waarskynlik in Wuhan. Daar kan voorgestel word dat as die virus in November 2019 wêreldwyd versprei het, dit enige plek kon begin het, en die feit dat dit die eerste keer in Wuhan opgespoor is, impliseer niks oor waar dit begin het nie.
Dit wil egter voorkom asof die Desember-uitbraak in Wuhan, waar dit die eerste keer opgespoor is, die grootste tot op daardie datum was. Boonop was Wuhan die volgende maand die eerste plek wat 'n plofbare uitbraak ervaar het wat die gesondheidsdienste belas het, 'n paar weke voor enige ander plek. Die feit dat dit voor die kurwe was in hierdie groter uitbrake, is 'n sterk aanduiding dat die virus die langste daar was en oorspronklik daar ontstaan het.
Molekulêre klok studies, wat die genetiese samestelling van vroeë gevalle ontleed om te bereken wanneer hul mees onlangse gemeenskaplike voorouer bestaan het, is geneig om die virus se opkoms laat Oktober of vroeg in November te plaas, wat ooreenstem met die wêreldwye verspreiding teen die einde van November.
In China, en uitgelekde regeringsverslag oor vroeë gevalle in Wuhan is nege pasiënte geïdentifiseer wat in November 2019 in die hospitaal opgeneem is met wat later as COVID-19 bevestig is (die vroegste simptoomaanvangsdatum was 17 November), hoewel hierdie nooit by die amptelike totaal gevoeg is nie. bestudeer het ook beweer dat hulle geen neutraliserende teenliggaampies in Wuhan-bloedskenkers in September tot Desember 2019 gevind het nie, hoewel dit onduidelik is hoe betroubaar dit is.
In Brasilië, gebankte afvalwatermonsters het positief geword vanaf 27 November 2019, wat dui op beduidende gemeenskapsverspreiding van SARS-CoV-2 aan die einde van die maand. Interessant genoeg, monsters uit Italië in 'n aparte studie het dit eers op 18 Desember positief geword. Geen afvalwater-positiewe resultate het vroeër as hierdie êrens opgedaag nie (behalwe vir 'n anomale positiewe vir Barcelona in Maart 2019 wat wyd beskou word as 'n vals positief).
Toetsing van rioolwater in Florianópolis, Brasilië vir SARS-CoV-2 RNA
In Engeland, Imperial se REACT-studie het vroeg in 2021 sowat 150 000 mense vir teenliggaampies getoets en diegene wat positief getoets het, gevra wanneer hulle onthou het dat hulle simptome gehad het. Dit het die volgende grafiek tot gevolg gehad.
'n Merkbare toename in simptomatiese siekte kan gesien word vanaf die einde van November 2019 tot 'n bestendige vlak wat deur die winter voortduur. Die plofbare uitbraak van die eerste golf in laat Februarie 2020 is ook duidelik sigbaar. Hierdie grafiek illustreer netjies hoe die virus maande lank op 'n lae vlak (drie maande in hierdie geval) kan sirkuleer, insluitend deur die wintergriepseisoen, voordat 'n plofbare uitbraak plaasvind, blykbaar onverwags.
Ons het nie goeie data van die Verenigde State oor vroeë verspreiding nie, aangesien die land konsekwent versuim het om studies oor gestoorde monsters van afvalwater of van individue te onderneem, behalwe vir een. Rooi Kruis-teenliggaamstudie wat teenliggaampies middel Desember 2019 gevind het, maar nie na vroeëre monsters gekyk of met toetse vir virale RNA bevestig het nie.
Nietemin was daar geen tekort aan nuusberigte uit die VSA wat die stories vertel het van verskeie individue wat in November 2019 siek geword het met 'n Covid-agtige siekte en later positief getoets het vir Covid-teenliggaampies (toe hulle intussen nie siek was nie).
Hierdie individue sluit in Michael Melham van New Jersey, wat berig dat hy saam met verskeie ander besmet is tydens 'n konferensie rondom 21 November 2019; Uf Tukel, wat berig dat hy saam met 10 ander aan die einde van November 2019 in Florida besmet is; Stephen Taylor en sy vrou, wat in November 2019 in Texas besmet is; en Jim Rust, dieselfde maand in Nebraska besmet. Bill Rice, Jr. het saam versamel die mediaberigte oor hierdie vroeë teenliggaam-bevestigde Amerikaanse gevalle. Dit is opmerklik dat geeneen van hulle beweer dat hulle voor November besmet is nie.
Hierdie bewyse van die verspreiding van die middel November in China, Brasilië, Engeland en Amerika is, dink ek, hoogs oortuigend; selfs al blyk een of twee van die gevalle verkeerd te wees, dink ek nie dit is waarskynlik dat almal verkeerd sal wees nie. Dit stem ook ooreen met die ramings van die voorgenoemde molekulêre klokstudies.
Hierdie bewyse dui daarop dat die virus nie veel vroeër wêreldwyd versprei het nie. Dit is gebaseer op die negatiewe resultate in die afvalwaterstudies, die weglaatbare vlakke in die Imperial-studie, die gebrek aan Amerikaners wat siekte aanmeld, en die afwesigheid van pasiënte in China. Die studies wat vroeër wêreldwye verspreiding as dit blyk te toon, kan wees as gevolg van kruisreaksie van teenliggaampies of kontaminasie van die hoë-vergroting PCR-toetsing.
Dit laat ons toe om tot die gevolgtrekking te kom dat die virus teen laat November 2019 op 'n lae vlak wêreldwyd versprei het, maar waarskynlik nie veel vroeër as dit nie. Wat het volgende gebeur?
Die uitbraak in die Huanan-mark blyk rondom 1 Desember begin te het – dit was die vroegste simptoomaanvangsdatum in die eerste groep bevestigde Covid-pasiënte, wat op 16 Desember in die hospitaal opgeneem is. Hierdie uitbraak blyk aansienlik groter te gewees het as ander uitbrake tot op daardie stadium. Teen 2 Januarie was 41 pasiënte bevestig is in die hospitaal opgeneem met 'n positiewe Covid-toets tesame met longontsteking en 'n kenmerkende borskas-CT-skandering; ses van hulle is later oorlede.
Dit was hierdie groep hospitalisasies wat gelei het tot die opsporing van die virus, soos ten minste nege monsters van hierdie pasiënte is tussen 24 Desember en 31 Desember 2019 deur klinici vir genomiese analise gestuur. Die opsporing van die virus in die natmark-uitbraak blyk dus 'n direkte gevolg te gewees het van die erns van daardie uitbraak – dit het aansienlik meer hospitalisasies veroorsaak as ander uitbrake tot op daardie stadium en het 'n aantal klinici aangespoor om onafhanklik monsters vir identifikasie te stuur. Dit het dit basies onvermydelik gemaak dat dit tydens hierdie uitbraak opgespoor sou word.
Dit gesê, die uitbreking was baie klein in vergelyking met die meeste van die golwe wat ons sedert 2020 gesien het, en inderdaad in vergelyking met wat die volgende maand in China gebeur het. As ons na die kurwe van aangemelde Covid-sterftes vir China in 2020 kyk, dui dit daarop dat die plofbare uitbreking in die streek eers in die eerste dae van Januarie begin het (deur ongeveer 20 dae terug te tel).
Dit mag verklaar waarom daar aanvanklik was onsekerheid oor die vraag of daar mens-tot-mens-oordrag was, terwyl dit teen 14 Januarie al hoe duideliker geword het dat daar wel was, aangesien hulle vir die eerste keer midde-in 'n plofbare oplewing was. Dit was waarskynlik ook die erkenning van hierdie plofbare uitbraak wat die Chinese owerhede aangespoor het om vanaf 23 Januarie beperkings op Wuhan in te stel.
Vreemd genoeg is die plofbare Januarie-uitbraak in die Hubei-provinsie nie in ander dele van China herhaal nie, wat op hierdie stadium grootliks ongestoord deur die virus gelaat is. In plaas daarvan was die volgende plek om 'n plofbare uitbraak te sien. Suid-Korea, meer as 'n maand later in Februarie, en weereens was dit vreemd genoeg grootliks beperk tot een stad, Daegu. Dit was op 'n soortgelyke skaal as die Wuhan-uitbraak met 'n soortgelyke aantal sterftes.
Volgende was dit die beurt van Italië en Iran om plofbare uitbrake te ervaar, wat middel Februarie begin. Die uitbraak in Italië was steeds hoofsaaklik beperk tot een deel van die land, hoewel die omvang daarvan verder was as enigiets wat tot dusver gesien is, en die Iranse uitbraak was van 'n soortgelyke omvangDaarna het New York en die noordoostelike Verenigde State gevolg, en ook Engeland, Frankryk en 'n groot deel van Wes-Europa (alhoewel nie Oos-Europa of 'n groot deel van die res van die VSA nie). Al hierdie uitbrake was baie nader tot die groter Italiaanse skaal as die Chinese en Suid-Koreaanse skaal. Ander plekke het voortgegaan met lae verspreiding totdat hulle hul eerste plofbare golwe later in 2020 gehad het, of in sommige gevalle in 2021 of selfs 2022.
Wat my hieraan tref, is hoe die grootte en omvang van die uitbrake stapsgewys toegeneem het tussen November 2019 en Februarie 2020. Die verspreiding in November 2019 was wêreldwyd, maar op 'n lae vlak. In Desember het die Wuhan-natmark-uitbraak dinge 'n kerf opgeneem, wat gelei het tot 'n hoër aantal hospitalisasies en dus die opsporing van die virus. Toe, in Januarie, het Wuhan die eerste plofbare Covid-uitbraak en sterftegolf ervaar. En in Februarie het die groot Europese en Amerikaanse golwe begin, wat die skaal met nog 'n paar kerwe verhoog het, waar dit grootliks gebly het. (Omicron, toe dit laat in 2021 verskyn het, het die grootte van uitbrake selfs verder verhoog, maar die sterftesyfer aansienlik verminder.)
Dit bied, glo ek, 'n akkurate beeld van hoe die virus ontstaan het – via 'n stapsgewyse beweging na groter en groter uitbrake vanaf 'n ongunstige begin van lae verspreiding in November. Hierdie beweging is, neem ek aan, 'n gevolg van genetiese veranderinge in die virus, wat die oordraagbaarheid daarvan in verskillende bevolkings en kontekste verander – 'n hipotese wat ooreenstem met die gevolgtrekkings van molekulêre klokstudies.
Ons kan dus, dink ek, redelik seker wees dat die virus die eerste keer in Wuhan gedurende die herfs van 2019 ontstaan het en nie net daar opgespoor is nie, aangesien Wuhan die eerste keer die groter uitbrake in beide Desember en Januarie ervaar het, wat daarop dui dat die virus die langste daar was.
Herdruk van DaaglikseSkeptiese